การทําลายของสารปนเปื้อนในการบําบัดน้ําเสียเป็นกระบวนการการกําจัดระดับและการทําความสะอาดอย่างช้าช้า โดยมีขั้นตอนหลักแบ่งออกเป็น 4 ขั้นตอน คือ การบําบัดก่อน, การบําบัดพื้นฐาน,การบํารุงรักษาครั้งที่สอง, และการบํารุงรักษาชั้นสามัญ แต่ละชนิดเป้าหมายชนิดของสารพิษที่แตกต่างกัน
เป้าหมายหลักคือการกําจัดละอองของอนุภาคขนาดใหญ่ เพื่อป้องกันการอุดตันในอุปกรณ์ภายหลังผ่านหน้าจอบาร์ (เพื่อกรองขยะลอย เช่น กิ่งไม้และถุงพลาสติก) และห้องก้อนหิน (เพื่อแยกอนุภาคที่ไม่เป็นอินทรีย์เช่นดินและหินผ่านแรงโน้มถ่วง), สารปนเปื้อนทางกายภาพในน้ําเสียจะลดลงในตอนแรก, ลดภาระต่อกระบวนการการบํารุงรักษาภายหลัง.
เน้นเรื่องของสารแข็งในระบาย (SS) และ COD ส่วนหนึ่ง โดยที่อํานวยความสะดวกหลักคือถังปูนและอนุภาคที่แขวนลงลงบนพื้นใต้แรงโน้มถ่วงในขณะเดียวกัน, น้ํามันลอยถูกกําจัดผ่านเครื่องแยกน้ํามัน. ขั้นตอนนี้สามารถกําจัดประมาณ 30% ของ COD และ 60% ของ SSแต่มันไม่สามารถทําลายสารอินทรีย์ละลาย หรือไนโตรเจนและฟอสฟอรัสได้.
การใช้กระบวนการเผาผลาญของจุลินทรีย์เพื่อแยกสารอินทรีย์หลอมละลาย ไนโตรเจน ฟอสฟอรัส และสารปนเปื้อนอื่น ๆ เป็นขั้นตอนสําคัญในการทําความสะอาดน้ําเสียโดยกระบวนการหลักแบ่งออกเป็น 3 ขั้นตอน: อีโรบิก, ออนอ๊อกซี่, และเอโรบิก
ขั้นตอนการทํางานแบบอนาเอโรบิก: ในสภาพแวดล้อมที่ไม่มีออกซิเจน แบคทีเรียอนาเอโรบิกจะแยกสารอินทรีย์ขนาดใหญ่ (เช่นโปรตีนและเมล็ด) เป็นกรดอินทรีย์โมเลกุลเล็กและเมธานการลดภาระในระยะแอโรบิกต่อไป.
พื้นที่ไม่มีแอเนอโรบิค: แบคทีเรียที่เลือกจะทําให้เกิดการลดไนไตรในสภาพที่ไม่มีออกซิเจนโมเลกุล แต่มีไนไตรต์ โดยเปลี่ยนไนไตรท์เป็นแก๊สไนไตรท์ที่ปล่อยออกมาในอากาศ
ระยะแอโรบิก: การอากาศและการออกซิเจน ซึ่งแบคทีเรียแอโรบิก (เช่นแบคทีเรียฟล็อกคูลันต์และแบคทีเรียไนทริฟิเกอร์) เพิ่มจํานวนมากการออกซิเดนและการย่อยย่อยสารอินทรีย์โมเลกุลขนาดเล็กเป็น CO2 และ H2O; แบคทีเรีย nitrifying ยังสามารถแปลงอะโมเนียกไนโตรเจนเป็นไนโตรเทต, ทําให้การกําจัดไนโตรเจน.
หลังจากปฏิกิริยาทางชีวเคมี ไมโครออร์แกนิซัมจะรวมกับสารปนเปื้อนเพื่อสร้างสลัดที่ทํางาน ซึ่งถูกแยกโดยการปนเปื้อนในเครื่องทําความชัดระดับรองสารที่อยู่เหนือตัวเข้าสู่กระบวนการการบําบัดต่อมาขณะที่ส่วนหนึ่งของ sludge จะถูกนําไปหมุนเวียนใหม่เพื่อรักษาประชากรของจุลินทรีย์ในระบบ และส่วนหนึ่งจะถูกปล่อยเพื่อการบําบัดต่อไป
เพื่อที่จะระบายความสะอาดของไนโตรเจนและฟอสฟอรัสที่เหลือ, ซัลดีดที่แขวน และสารอินทรีย์ที่ทนไฟในน้ําเสียทางบ่อยเพื่อตอบสนองมาตรฐานการปล่อยที่สูงกว่า, กระบวนการทั่วไปประกอบด้วย:
การกําจัดฟอสฟอรัสทางเคมี (เพิ่มสารตึง เช่น PAC และ PFS เพื่อสร้างสารตกของฟอสฟาต)
การกรองผ่านผิวหนัง (ตัวอย่างเช่น ผิวหนัง MBR จับยั้งซับซ้อนที่เหลือและจุลินทรีย์)
การฆ่าเชื้อ (เพิ่มซาเดียมไฮโพลอริท, การฆ่าเชื้อ UV และการกําจัดเชื้อโรค)
น้ําที่ได้รับการบําบัดสุดท้ายสามารถถูกปล่อยออกมาโดยตรง หรือนําไปใช้ใหม่ (เช่น สําหรับการปรับปรุงผืนดินหรือล้างห้องน้ํา)
